こんにちは。

> 要素の存在するレイヤーを、いらないからと思いそのままレイヤー削除をすると、
> その後、トラップ２点目を指示したときに外部例外エラーが発生しトラップできなくなります。

症状が確認できましたので修正版（Ver7.84b1）をお試し下さい。

> それとずいぶん前にあったのですが、
> 終了時未保存だった為、保存しますか？と聞かれ、はいをクリック。
> 保存に失敗しましたとメッセージが出現。
> 手動でってことね、と思いながらダイアログを閉じたら鍋CADが終了してしまい、作業やり直しになってしまいました。
> 保存に失敗すること自体、簡単に発生するものではありませんが、こういった場合、終了処理のキャンセルをするようお願いします。

これは、上記エラーが出たためシステムのエラーハンドラに制御を奪われているため回避出来ないのです。
発生元のエラーを修正すれば直ります。