鍋ビュワ Version 3.16b2 を体験版として使用してみました。

Zシフトを実行するとシーケンス番号後のコメント(T番号 工具名 H番号)が削除されました。
何か設定があるのでしょうか。

それと現在の鍋CADは材料厚みをコメントとして出力しています。
これを利用してZ値の変換を自動で行えないでしょうか。