> 本当ならCADで描かれている全ての要素が加工対象となり、
> そのすべてを加工し終えた後、スタートポイント位置にG40G00で
> 戻るのがベストだと思います。
>
> 何とかならないでしょうか?

何ともなりませんね。
そもそも開輪郭加工はレーザー用なのですが、レーザーの場合は元の位置に返す事は殆どありません。
仕様という事でご理解下さい。