> スクリプトでボールエンドミル加工などをよく行なうのですが、
> ローカル座標を使用し、スクリプトでも一時的に原点位置を変えることが出来ないでしょうか?

システム変数値取得関数を利用すれば良さそうな気がします。
GetLocalX(),GetLocalY()

使用例
Writeln('G03' + NcTag('X', EX+GetLocalX()) + NcTag('Z', EY+GetLocalY()) + NcTag('I', AI) + NcTag('K', AJ));

いかがでしょうか？