やはり、端点へのアプローチを厳格にしたための副作用です。
今の判定方法は、直線をパラメータ型に変換して、位置情報を係数で判定しているからです。
（この場合直線の長さによって判定が変動してしまうからです）
分かりやすいように端点から0.1mm以内を拒否するように今改造しています。
少々お待ちください。