こんにちは。

> ページ内にレイヤーがある場合でトラップを行ないたいのですが
> トラップ(T)だとレイヤーを含めてトラップが可能です。
> 仕分けトラップ、輪郭トラップ(Z)、トラップ変更に関してはレイヤーが
> 分かれてると選択できません。
> 何か設定があるのでしょうか。

いえ不具合です。
今修正版を載せましたので、Ver7.76b1を使ってみて下さい。
ご報告ありがとうございました。