いらっしゃいませ。

> ヘルプを何度読み返しても自動穴加工が出来ません＞＜
> ＪＷＷで作図したのを読み込んでいるのですが
> 「対象穴が検索できません」とメッセージが出てしまいます。
> なぜでしょうか？

↓ヘルプからの引用ですが、検索条件には当然ルールがあります。

※円の場合は半径・色・線種が同じもののみ検索対象になります。
※検索円の直径の誤差は0.0001mm以下でなければなりません。
※自動穴の認識個数は、2,000個まで可能です。

どれか違っていませんか？
また、円弧は検索しませんので、解析にて円なのか円弧なのか確認してみて下さい。