おはようございます。

> 今、行程情報表示後１秒以内にOKしてみましたが、問題の症状が再現できませんでした。
> 使用コマンドは「自動穴」ですよね？

使用コマンドは「手動穴」です。
点や円を任意の位置に任意の大きさで２個描いた後（1個は原点用）、ミル操作しても再現できました。
異なる３台のＰＣで同じ現象を再現することができました。
ただし、正常に出力される場合もあり、こうすると必ずこうなる、というところまで特定できません。

ちなみに、一連の操作をした後、ミル終了する前に、マウスミルでエンドミルによる任意の横引き工程を入力して、工程削除でマウスミル操作をなかったことにすると、なんとか正常に出力されるようです。
何か関係があるのでしょうか？

原因が不明なので、上記マウスミル操作をして削除する、という作業をしてなんとかしのいでいます。

出力されたＮＣデータからでも、なんとか原因がわからないものでしょうか？

すいませんが、よろしくお願いします。