> 　「電子辞書」なんかはこんな感じではありますね。
> 鍋ＣＡＤを新規に立ち上げた（再起動を含む）場合に　このままだとちょっと違和感というか反対に問題になるのかな。
> なんか両立できる「神の手」はないかなとも思います。

ファイルを開くと言っても以下4通りあります。
・メニュー（ボタンも含む）から開く
・ファイル履歴（ヒストリー）メニューから開く
・ドラッグ＆ドロップで開く
・関連付けを用いて開く

これだけ実装していれば、十分ではないでしょうか？